Mit der Unterstützung von der „Gesellschaft der Freunde“ gelangte er als politischer Flüchtling nach Veracruz, Mexiko. Von hier aus wurde er neben weiteren Flüchtlingen nach Mexiko-Stadt befördert und dort durch die Vertreter der spanischen Republikaner untergebracht (Der Regent der spanisch-republikanischen Partei Juan Negrin erwarb riesige Ländereien im nördlichen Teil Mexikos, um dort politisch Verfolgte Spanier unterzubringen.). Kurze Zeit später erhielt Candela den Posten eines Architekten in einer spanischen Arbeiterkolonie, welche über 100 Kilometer nördlich von Chihuahua gelegen war. Dort heiratete er 1940 Eladia Martin, die er bereits in Madrid kennen gelernt hatte. Beide nahmen im folgenden Jahr die mexikanische Staatsbürgerschaft an. Nach der Auflösung der Kolonie kam Candela zurück nach Mexiko-Stadt, um hier als Zeichner in einer kleinen Baufirma zu arbeiten. Zwischen den Jahren 1940 und 1948 arbeitete Candela als freischaffender Architekt bei verschiedenen Architektur- und Konstruktionsfirmen. Während dieser Zeit stieß er auf einen Artikel über Faltwerke von George Winter und Minglung Pei im American Concrete Institute Journal. Dieser Artikel entfachte von neuem sein früheres Interesse an dünnen Schalenkonstruktionen. Wieder begann er fremdsprachige Aufsätze über Schalen in den Abendstunden zu studieren. Neben englischen, deutschen und französischen Artikeln befanden sich diesmal auch schwedische und dänische darunter.

Offen und abenteuerlustig wie Candela war, begab er sich 1948 gemeinsam mit seinem Bruder Antonio auf neues Terrain. Der Ausgang war der glückliche Gewinn des Großen Loses der Nationallotterie durch Antonio. Das Geld investierten sie in die Produktion von Filmen. Nach dem Dreh zweier eher minder qualitativer Streifen war ihr Vermögen schnell aufgebraucht und die beiden Brüder waren arbeitslos. Candela begann ein Jahr lang Schaumbeton zu studieren. Da es an Geld mangelte, konnte er die Forschung nicht weiter führen. Der Weg aus der Misere schien die Gründung einer neuen Firma im Bausektor. Zusammen mit seinem Bruder Antonio und seiner Schwester Julia instituierte er 1949 die „Cubiertas Ala, S. A.“, deren Präsident er bis 1969 blieb. Bis dahin errichtete er mit dem System der geregelten Flächen über 896 Bauwerke.

Seit 1950 begann Candela selbst Artikel – unter anderem zum Thema „geregelte Flächen“ – zu verfassen. In seinen Veröffentlichungen neigte er dazu, die konventionellen Berechnungen der Ingenieure anzuzweifeln. Sein erster Veröffentlichungsversuch im „ACI Journal“ wurde als zu „streitsüchtig“ abgelehnt. Als Candela 1954 den erfolgreichen Aufsatz „Stereo-Structures“ (dt. „Stereo-Strukturen“) in „Progressive Architecture“ veröffentlicht hatte (Unter „Estereo éstrukturas“ erstmals 1953 in „Espacios“ (Nr. 17, Mexiko) erschienen.), wurden weitere Artikel von ihm verlangt, da es an Kenntnis der einfachen Schalenkonstruktionen mangelte. Sein Ansehen in der Fachwelt stieg und zwei Jahre später erhielt Candela eine Lehrtätigkeit als Dozent für Projektplanung und Material-Festigkeitslehre an der „Escuela Nacional de Arquitectura“ der UNAM.

Als der Bau der Kirche (Iglesia) „de la Virgen Milagrosa“ (dt.: „der Wundertätigen Jungfrau“, auch: „La Milagrosa“) in Mexiko-Stadt im Jahr 1954 halb fertig gestellt war, wurde Candela zu einer Konferenz über Schalenbau am „Massachusetts Institute of Technology“ eingeladen. Dort hielt er zwei Vorlesungen. Da sein Englisch so unverständlich war, wurde die zweite Vorlesung von jemandem anderes vorgelesen, während Candela die Gleichungen auf eine Tafel schrieb. Die Fertiggestellung der Kirche „La Milagrosa“ 1955 machte Candela zum bekanntesten Schalenbauer seiner Zeit. Es war ein Werk besonderer Qualität, das von keinem Architekten und Ingenieuren dieser Zeit ausgedacht und genauso wenig ausgeführt werden konnte. Nach diesem Ereignis wurde Candela häufig dazu eingeladen, insbesondere in die Vereinigten Staaten, Vorlesungen zu halten. Daneben stieg die Anzahl seiner Auftraggeber. Allein in diesem Jahr wurden von Candela 31 Bauwerke umgesetzt.

Die Kapelle „Unserer Lieben Frau“ eröffnete die Serie von Gebäuden, die Candela in Zusammenarbeit mit Enrique de la Mora und Fernando Lopez Carmona ausgeführt hat. Das Dach dieser Kirche ist ein vier Zentimeter dünnes Hypar. Zu dieser Serie zählen auch der Hauptsaal der neuen Börse, die Kirche „Sankt Antonius im Obstgarten“, die Kirche „Sankt Josef der Handwerker“, die Kapelle „Sankt Vinzenz von Paul“ und die Kirche der „Heiligen Monika“. Während des Entwerfens des Hauptsaals der neuen Börse stieß Candela auf das Problem des freien Randes. Dieses wurde zum wichtigsten Thema in den späteren Bauten Candelas. Das beste Beispiel hierfür ist das Restaurant „Los Manantiales“ aus den Jahren 1957/1958.

Für die Olympiade im Jahr 1968 entwarf Candela den Olympischen Sportpalast, dessen Ausführung er auch leitete. Dieses Gebäude war das letzte Werk Candelas in Mexiko. 1971 kehrte er Mexiko den Rücken und ließ sich in den Vereinigten Staaten von Amerika nieder. Dies führte zur Schließung des Familienbetriebs und zum Ende seiner Lehr- und Bautätigkeit in Mexiko. In Chicago eröffnete er ein internationales Beratungsbüro und widmete einen Teil seiner Zeit der Lehrtätigkeit als Professor für architektonische Projekte an der Universität von Illinois. 1978 erhielt Candela die amerikanische Staatsbürgerschaft.

Im Jahr 1980 besuchte Candela seinen Geburtsort Madrid, wo er nun ebenfalls als freischaffender Fachberater tätig wurde. Hier begann auch die berufliche Verknüpfung mit Santiago Calatrava, der ihn zur Mitarbeit an dem Projekt der „Ciudad de las Artes i las Ciencias en Valencia“ (Stadt der Künste und Wissenschaften in Valencia) einlud. Die Struktur des Projektes „L’Oceanografie“ wurde von Candela übergenommen. Seine Handschrift und die Ähnlichkeiten des Restaurants „Los Manantiales“ zu anderen Bauwerken dort werden sofort deutlich.

Noch zu Lebzeiten des Ingenieurs und Architekten organisierte der spanische Staat im Jahre 1994 eine Retrospektive über Candelas Leben und Werk in Madrid. Am 7. Dezember starb Candela an einer schon länger bestehenden Herzschwäche in Durham, North Carolina, USA.