12736 - Bioinformatik Modulübersicht

Modulnummer: 12736
Modultitel:Bioinformatik
  Bioinformatics
Einrichtung: Fakultät 2 - Umwelt und Naturwissenschaften
Verantwortlich:
  • Dr. rer. nat. habil. Rödiger, Stefan
Lehr- und Prüfungssprache:Deutsch
Dauer:1 Semester
Angebotsturnus: jedes Sommersemester
Leistungspunkte: 5
Lernziele:Da die Molekularbiologie immer mehr von der Bioinformatik abhängig ist, liefert dieses Modul auch grundlegende Informationen über die Nutzung von Datenbanken und die webbasierten Werkzeuge, die für die Suche und Extraktion der relevanten Informationen notwendig sind (Sequenzen, Proteinstrukturen, genomische Informationen, tägliche Anforderungen des molekularbiologischen Labors).
Kompetenzen: Kenntnisse der molekularbiologischen Nomenklatur. Ein grundlegendes Verständnis der wichtigsten Gen- und Proteinfunktionen. Verständnis der Konzepte molekularbiologischer Experimente (Klonierungs- und Expressionssysteme, Erzeugung von Fusionsproteinen, Reportergene, Konstruktion künstlicher Gene, Mutagenese in-vitro und in-vivo). Grundkenntnisse molekularbiologischer Analyseverfahren (Sequenzierung, Microarray, Real-Time PCR, genomweite Analyse von RNA und DNA). Die Fähigkeit, publizierte Daten und Konzepte in peer-reviewed Journals zu verstehen und zu interpretieren. Ein großes Anliegen ist es, die Interdisziplinarität der Molekularbiologie hervorzuheben, die fast alle Aspekte der Biologie, Biochemie und Medizin beeinflusst. Kenntnisse über die wichtigsten webbasierten Werkzeuge der Bioinformatik und deren Anwendbarkeit auf "alltägliche" molekularbiologische Aufgaben wie Datenbanksuche, Sequenzvergleich, Proteinstruktur-Funktionsbeziehung, Homologieanalyse. Ein allgemeines Verständnis des Begriffs “Datenbank”.
Inhalte:Die Vorlesung Bioinformatik wird von einem "Hands-on"-Kurs begleitet, in dem die Bioinformatik-Werkzeuge zu "alltäglichen molekularbiologischen Problemen" eingesetzt werden. Web-basierte Programme wie NCBI's (psi)BLAST, BRENDA, Pfam, ClustalW2, ScanProsite, UniProt, DeepView und andere werden während der Vorlesung erklärt und von den Studenten genutzt, um Probleme zu lösen, auf die sie bei ihrer eigenen Laborarbeit stoßen könnten.
Der Lernprozess wird durch "echte Bioinformatik-Probleme" ergänzt, die in den "Hands-on"-Übungen mit den beschriebenen und in der Vorlesung praktisch angewandten Programmen gelöst werden.
Am Ende des Moduls sind die Studierenden in der Lage, sich relevante Softwarepakete zu merken und die zu lösenden Probleme zu verstehen. Sie sind in der Lage, das am besten geeignete Programm für ihre eigenen Experimente anzuwenden. Sie können die gewonnenen Daten analysieren und auswerten und sollten in der Lage sein, verschiedene neue Ansätze für die Arbeit im Bereich der Bioinformatik zu entwickeln.
Empfohlene Voraussetzungen:keine
Zwingende Voraussetzungen:keine
Lehrformen und Arbeitsumfang:
  • Vorlesung / 2 SWS
  • Übung / 2 SWS
  • Selbststudium / 90 Stunden
Unterrichtsmaterialien und Literaturhinweise:Programme der führenden Bioinformatik-Organisationen im WWW
Modulprüfung:Modulabschlussprüfung (MAP)
Prüfungsleistung/en für Modulprüfung:Schriftliche Prüfung 60 min.
Bewertung der Modulprüfung:Prüfungsleistung - benotet
Teilnehmerbeschränkung:keine
Zuordnung zu Studiengängen:
  • Abschluss im Ausland / Biotechnologie / keine PO
  • Bachelor (fachhochschulisch) / Biotechnologie / PO 2018
  • Bachelor (fachhochschulisch) - Doppelabschluss / Biotechnologie / PO 2021
Bemerkungen:Die Lehrveranstaltungen (Vorlesung und Seminar) finden als Blockveranstaltung in der Zeit vom 10. – 21. August statt. Der Prüfungstermin wird noch bekannt gegeben.
Veranstaltungen zum Modul:
  • Vorlesung Bioinformatik
  • Übung Bioinformatik
  • Prüfung Bioinformatik
Veranstaltungen im aktuellen Semester: