Die ökologisch-ökonomische Modellierung führt die Ergebnisse des ökologischen Modells sowie der agrarökonomischen Kostenberechnung zusammen. In einem ersten Schritt werden hierfür die Kosten und Nutzen der im Projekt untersuchte Instrumente des Biodiversitätsschutzes (Anreizzahlungen für Naturschutzmaßnahmen, Kompensationsmaßnamen und Landkauf für Naturschutzzwecke) für die Arten simuliert. In einem zweiten Schritt wird dann die Optimierung vorgenommen. Zwei Optionen werden entwickelt: 1) der bestmögliche Erhalt der Art unter Klimawandel für ein gegebenes Budget und 2) Minimierung des Budgets unter der Bedingung, dass die Art unter Klimawandel erhalten bleibt.